Um ex-membro de um clã ninja desistiu para viver uma vida tranquila com sua esposa e filho. Uma noite, sua família morre após ser atacada por uma organização misteriosa. O homem é torturado pelas consequências.

A paz é repentinamente quebrada quando as sirenes de alerta soam através da Soul Society. Os moradores estão desaparecendo sem deixar rastro e ninguém sabe quem está por trás disso.

The Federation and Neo-Zeon collaborate to capture a rogue suit.